I giocatori competono in due squadre in Decrypto, con ciascuno che cerca di interpretare correttamente i messaggi in codice presentati loro dai loro compagni di squadra mentre decifrano i codici che intercettano dalla squadra avversaria.
Più in dettaglio, ogni squadra ha il proprio schermo, e in questo schermo si infilano quattro carte in tasche numerate da 1 a 4, lasciando che tutti nella stessa squadra vedano le parole su queste carte mentre nascondono le parole alla squadra avversaria. Nel primo turno, ogni squadra fa quanto segue: Un membro della squadra prende una carta di codice che mostra tre delle cifre 1-4 in un certo ordine, ad esempio, 4-2-1. Poi dà un messaggio in codice che i suoi compagni di squadra devono usare per indovinare questo codice. Per esempio, se le quattro parole della squadra sono "maiale", "caramella", "tenda" e "figlio", allora potrei dire "Sam-striscia-rosa" e sperare che i miei compagni di squadra possano correttamente mappare queste parole su 4-2-1. Se indovinano correttamente, bene; se no, riceviamo un marchio nero di fallimento.
A partire dal secondo turno, un membro di ogni squadra deve nuovamente dare un indizio sulle parole da abbinare a un codice numerato. Se ottengo 2-4-3, potrei dire: "sucker-prince-stake". L'altra squadra cerca allora di indovinare il nostro codice numerato. Se sono corretti, ricevono un segno bianco di successo; se no, allora la mia squadra deve indovinare il numero correttamente o prendere un segno nero di fallimento. (Indovinare correttamente non fa altro che evitare il fallimento e dare alla squadra avversaria informazioni su quali potrebbero essere le nostre parole nascoste).
I turni continuano finché una squadra non raccoglie il suo secondo punto bianco (vincendo il gioco) o il suo secondo punto nero (perdendo il gioco). Le partite in genere durano da 4 a 7 turni. Se nessuna delle due squadre ha vinto dopo otto turni, allora ogni squadra deve tentare di indovinare le parole dell'altra squadra; la squadra che indovina più parole correttamente vince.