Nel gioco Azul, i giocatori a turno pescano le tessere colorate dai fornitori sul loro tabellone. Nel corso del turno, i giocatori ottengono punti in base a come hanno posizionato le tessere per decorare il palazzo. I punti extra vengono assegnati per motivi specifici e per il completamento di set; i rifornimenti sprecati danneggiano il punteggio del giocatore. Vince il giocatore con il maggior numero di punti alla fine della partita.
Azul: Master Chocolatier include schede di fabbrica a doppia faccia, sulle quali vengono posizionate le tessere all'inizio di ogni turno. Un lato delle fabbriche è vuoto, e quando si usa questo lato il gioco si svolge esattamente come Azul. L'altro lato di ogni tessera fabbrica ha un effetto speciale che modifica il gioco in un modo o nell'altro, dando una svolta al gioco normale. Inoltre, le tessere sono modellate in modo da sembrare cioccolatini e altre prelibatezze, pur rimanendo non commestibili, come le tessere del gioco originale.